Фамилия Панфлова — женская форма фамилии Панфлов, а та, в свою очередь, образована от просторечного имени Панфл. В основе лежит каноническое крестильное имя Панфил (от греческого «панфилос» — «всеми любимый»). В русской народной речи имя Панфил часто редуцировалось до Панфл: выпадение гласного «и» в безударном положении — обычное явление для живой речи. Суффикс -ов указывает на принадлежность: Панфлов буквально значит «сын Панфла».

Интересно, что фамилия Панфлов и её женский вариант Панфлова встречаются реже, чем однокоренная Панфилов. Причина — в написании: церковная форма Панфил удерживалась в документах дольше, а народная Панфл оставалась в быту. Поэтому Панфловы — это, скорее всего, потомки крестьян или мещан из регионов, где приказные люди записывали имя «на слух», без оглядки на церковный устав. Географически фамилия тяготеет к центральным и южным губерниям России, где имя Панфил было распространено среди простонародья.

Словообразовательная модель проста: к основе Панфл- добавили типичный русский патронимический суффикс -ов, а затем стандартное окончание -а для женского рода. Никаких редких суффиксов вроде -их или -ский здесь нет, что указывает на позднее оформление фамилии (не ранее XVII–XVIII веков), когда патронимы уже вытесняли прозвища. Социальный контекст: Панфловы — не дворянский род, а крестьянская или посадская фамилия, возникшая в эпоху, когда фамилии массово закреплялись за податными сословиями.

Спорных версий происхождения нет: корень прозрачен, альтернативные толкования (например, от слова «пан» с добавлением «фл») лингвистически несостоятельны. Единственный нюанс — возможная путаница с фамилией Панфёров, где основа та же, но суффикс -ер указывает на профессиональное прозвище (панфёр — нечто вроде «пекарь» или «хлебопашец»), но к Панфловым это отношения не имеет.