Фамилия Папеевы — редкий случай, когда основа угадывается не сразу, а суффикс может ввести в заблуждение. На первый взгляд, перед нами типичная модель на -ев, но здесь есть нюанс: если бы фамилия строилась от имени Папа или прозвища Папа, мы бы получили Папин или Папов. Папеев же указывает на основу, оканчивающуюся на «ей» или на смягченный согласный: Папей, Папейка, Папейко.

Самая вероятная версия — происхождение от канонического имени Паисий (греч. «дитя»), которое в народной речи могло звучать как Папей или Папейка. Уменьшительные формы на -ей (-ейка) в русской ономастике обычны: от Григорий — Гришей, от Паисий — Папей. Соответственно, Папеев — «сын Папея», то есть потомок человека, которого в быту звали Папеем. Менее вероятная, но возможная версия — отчество от прозвища Папей, данного за мягкий или детский характер (от «папа» в ласкательном значении).

Географически фамилия тяготеет к северным и центральным регионам России, где старые формы на -ей (-ейка) сохранялись дольше. Встречается она редко, поэтому носители Папеевых, скорее всего, происходят из одного или нескольких локальных гнезд — например, из бывших крестьян или мещан. В дворянских родословных книгах фамилия не значится.

С точки зрения словообразования, Папеевы стоят в одном ряду с фамилиями Матвеев (от Матвей), Андреев (от Андрей), но с той разницей, что имя Папей не попало в святцы, а осталось народной формой. Поэтому точное значение восстанавливается через церковное имя Паисий, которое в русском быту сократилось и обросло суффиксами. Если ваш предок носил эту фамилию, он, скорее всего, был потомком человека по имени Паисий, которого в деревне звали Папей.