Фамилия Парфонов — это типичная русская фамилия, образованная от имени. Если коротко: предка носителя этой фамилии звали Парфон. Такое имя — это народная, просторечная форма церковного имени Парфений.

В основе лежит греческое «парфенос», что переводится как «девственник», «чистый». Имя Парфений в святцах связано с несколькими раннехристианскими святыми, поэтому на Руси оно было хорошо известно. Однако в быту, в крестьянской и купеческой среде, полная церковная форма часто сокращалась или упрощалась. Так Парфений превращался в Парфёна, а затем, с типичным для северных и центральных говоров «оканьем» (когда чётко произносится «о»), — в Парфона. От этой усечённой формы и пошла фамилия с суффиксом -ов, который указывает на принадлежность: буквально «сын Парфона».

Стоит обратить внимание на одну деталь, которая отличает эту фамилию от более распространённой Парфёнов. Написание через «о» (Парфонов) может указывать на то, что фамилия закрепилась в письменных документах именно в такой, «окающей» форме. В русской ономастике это не ошибка, а живой след диалектного произношения. Если бы фамилия фиксировалась в Москве или в южных регионах, где «акают», она, скорее всего, писалась бы как Парфёнов (через «ё» или «е»). Таким образом, вариант Парфонов — маркер северного или восточного происхождения рода.

По социальному составу фамилия Парфонов — почти наверняка крестьянская или мещанская. Имя Парфон было распространено именно в простонародье, среди духовенства и дворянства предпочитали полную форму Парфений. Встречается она и сегодня, хоть и не входит в сотню самых частых русских фамилий. Её носители — это потомки людей, которых в XV–XVII веках в документах записывали как «Парфон, сын такой-то», а позже это прозвание закрепилось за целым родом.