Фамилия Пастаухин — редкий случай, когда прозвище, лёгшее в основу, почти не оставило следов в письменных источниках, но хорошо восстанавливается по живым говорам. Разбираем её по частям: корень, суффикс и вероятное значение.

Основа фамилии — «пастаух». Это не церковное имя и не календарное слово. Скорее всего, перед нами прозвище, образованное от диалектного глагола «пастать» или «постать». В северных и сибирских говорах «пастать» означало «пасти», «стеречь», «присматривать». Но есть и другое, более редкое значение: «пастать» — «шататься без дела», «слоняться». Соответственно, «пастаух» — тот, кто пасёт (пастух), или, наоборот, человек, которого прозвали за бесцельное хождение. Вторая версия менее вероятна, но полностью исключать её нельзя: прозвища часто давали «от противного», с иронией.

Суффикс «-ин» указывает на принадлежность: Пастаухин — «сын Пастауха», «из рода Пастауха». Это типичная модель для русских фамилий, образованных от прозвищ и имён, оканчивающихся на согласный или «-а/-я». Если бы в основе было слово «пастух», мы бы ждали форму «Пастухов» — с суффиксом «-ов». Но здесь именно «Пастаухин», а значит, исходное прозвище звучало как «Пастауха» (женский род или ласкательная форма) или «Пастаух» (мужской род, но с основой на шипящий, что дало бы «-ин»). Скорее всего, это «Пастауха»: так могли назвать женщину-пастушку, жену пастуха или просто человека с соответствующей манерой поведения.

Географически фамилия тяготеет к северным и центральным областям России — там, где сохранялось диалектное «пастать». Встречается она редко, что говорит о локальном происхождении, возможно, из одной-двух деревень. В документах XVIII–XIX веков Пастаухины могли быть крестьянами или однодворцами — людьми, которые либо действительно пасли скот, либо получили прозвище за неспешный, «пасущийся» образ жизни.

Итог: Пастаухин — фамилия от прозвища, связанного с пастьбой или, реже, с праздным шатанием. Точное значение зависит от говора, но оба варианта укладываются в крестьянский быт. Это не дворянская фамилия и не книжное заимствование — чисто народное образование, которое почти не вышло за пределы своего региона.