Фамилия Пасунькин — из числа «профессиональных» прозвищ: её основа напрямую указывает на род занятий предка. В основе лежит прозвище Пасунька, которое в народной речи давали пастуху — тому, кто пас скот. Суффикс -уньк- придаёт слову ласкательный, обиходный оттенок, так что Пасунькой называли не вообще пастуха, а своего, «домашнего», привычного человека — например, деревенского пастуха, которого все знали в лицо.

Прозвище закрепилось за человеком как основное именование, а его дети и внуки стали писаться Пасунькиными. Такой способ образования фамилий — от уличного прозвища отца через притяжательный суффикс -ин — типичен для русских фамилий, особенно в северных и центральных губерниях, где пастушество было обычным промыслом. Суффикс -ин, а не -ов, указывает на основу на -а: Пасунька → Пасунькин, то есть «сын Пасуньки».

Интересно, что фамилия сохранила редкую уменьшительную форму, а не более очевидную основу «Пастух-». Это говорит о том, что прозвище возникло в живой разговорной среде, где пастуха называли не по официальному слову, а по-свойски. В говорах встречаются и параллельные формы — Пасун, Пасунок, — но именно Пасунька дала устойчивую фамилию.

Стоит оговориться: версия о связи с пастушеством — основная и наиболее правдоподобная, поскольку глагол «пасти» и его производные широко представлены в русских фамилиях (Пастухов, Пасечник, Пасенков). Иных убедительных этимологий у фамилии нет: попытки вывести её от имени или от географического названия выглядят натянуто и не подкреплены документальными источниками.

Таким образом, Пасунькин — это потомок Пасуньки, то есть человека, чья работа была связана с выпасом скота. Фамилия недворянская, крестьянская по происхождению, и в этом её ценность: она сохранила память о будничном, но важном труде предков, который кормил семью и определял место человека в общине.