Фамилия Пегушина образована от прозвища Пегуша, в основе которого лежит славянский корень «пег». «Пегав» по-словенски означает «пятнистый, веснушчатый». В русском языке слово «пегий» также означает «пятнистый», «крапчатый». Скорее всего, прозвища Пегуша получил веснушчатый человек. Таким образом, оно указывало на внешние особенности родоначальника Пегушиных. Веселовского записаны: Власий Пегуш, крестьянин, 1495 г., Новгород; Никита Пегуш, кузнец, 1586 г., Новгород. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Пегуша, со временем получил фамилию Пегушина.