Фамилия Перчун почти наверняка связана с прозвищем Перец. Исходное нарицательное «перец» — это растение с плодами, обладающими специфическим острым вкусом и употребляемыми как пряность. Отсюда и два основных толкования прозвища. Первое: оно указывало на род занятий — например, повара, который щедро сдабривал кушанья. Второе, более распространенное, — на характер: вспыльчивый, горячий, колкий человек, которого трудно «проглотить» в споре, вполне мог получить такое прозвище.

Есть и другая версия, не менее любопытная. В основе фамилии может лежать народная уменьшительная форма еврейского мужского имени Перец (Пэрэц). В переводе с иврита оно означает «прорывающийся». В этом случае Перчун — это не прозвище по характеру, а патроним, то есть прямое указание на имя отца или более дальнего предка. Обе гипотезы имеют право на существование, и выбор между ними зависит от конкретной семейной истории.

Обратим внимание на словообразовательную модель. Суффикс -ун в русских фамилиях и прозвищах часто придаёт основе экспрессивный, разговорный оттенок. Сравните: говорун, крикун, молчун. Перчун — это «тот, кто перчит», то есть делает резко, горячо, остро. Такая форма могла возникнуть независимо от имени собственного, просто как усиление прозвища Перец. Так человек с острым языком или вспыльчивым нравом получал более яркое, «действующее» именование.

Важно, что фамилия закрепилась именно в форме Перчун, а не Перцов или Перцев. Это говорит о том, что в основе лежала не столько фамильная модель «сын такого-то», сколько живое прозвище, которое прижилось в быту. Со временем оно легло в основу фамилии, и потомки человека, которого когда-то называли Перчун, унаследовали это имя как родовое. Таким образом, фамилия сохранила память о предке — либо поваре, любившем пряности, либо человеке с горячим темпераментом, либо носителе имени Перец.