Фамилия Перчун образована от прозвища Перец. Оно ведет свое начало от нарицательного «перец» - «растение, плоды которого имеют специфический острый вкус и употребляются в качестве пряности». Вероятно, прозвище Перец содержало указание либо на род деятельности основателя фамилии (повар), либо на особенности его характера и поведения (вспыльчивый, горячий). Согласно другой гипотезе, в основе фамилии Перчун лежит народная, уменьшительная форма еврейского мужского имени Перец (Пэрэц), которое в переводе на русский язык означает «прорывающийся» - Перчун. Так и прозвище Перец закрепилось за человеком в качестве наиболее употребительного именования, а со временем легло в основу фамилии Перчун. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Перец, со временем получил фамилию Перчун.