Фамилия Пердыков — редкий случай, где основа прозвища лежит на поверхности, но её смысл не стоит понимать буквально. В русских говорах и просторечии слово «перд» (или «пердыш») имело два значения. Первое — прямое, физиологическое, от глагола «пердеть». Второе, куда более вероятное для прозвища, — иносказательное: так в некоторых диалектах называли ворчуна, брюзгу или капризного, недовольного человека. Прозвище Пердыка могли дать не за дурной запах, а за характер — вечно недовольному, «пускающему газы» в переносном смысле, то есть ворчащему и бранящемуся.

Словообразовательная модель проста и типична для русских фамилий. Суффикс -ов указывает на принадлежность: Пердыков — сын Пердыки. Это патронимическая фамилия, образованная от прозвища отца. Аналогично возникли фамилии Ворчунов, Брюзгин, Крикунов — все они описывали манеру поведения человека, а не его физический недостаток. В этом ряду Пердыков стоит на грани просторечия и диалекта, что делает фамилию редкой и территориально привязанной.

Географически фамилия встречается спорадически, в основном в центральных и северных областях России, где диалектная лексика сохранялась дольше. В дореволюционных переписях она почти не фиксируется — вероятно, из-за неблагозвучия для писаря, который мог «исправить» фамилию на более благородную, или из-за того, что носители сами меняли её при переездах. Поэтому Пердыков — фамилия, которая почти наверняка не имела дворянских корней; её носили крестьяне или посадские люди, и прозвище давалось в быту, а не при официальном документировании.

Есть и более спорная версия, которую приводят некоторые краеведы: связь с диалектным словом «перда» — вид гриба-дождевика, который в народе называли «дедушкин табак» или «пердунок». В этом случае прозвище могло относиться к сборщику грибов или человеку, похожему на этот гриб (низкому, круглому). Однако эта гипотеза слабее: слово «перда» в значении гриба известно только в нескольких говорах, а прозвища по поведению встречаются в десятки раз чаще, чем по грибам. Поэтому основная версия — характер, а не ботаника.