Фамилия Перькова — отчество от прозвища или имени Перько. Если отталкиваться от самого простого и наглядного объяснения, то в основе лежит слово «перо». Прозвище Перько могли дать человеку, чья торговля или ремесло были связаны с этим предметом. Например, торговцу пером для перин и подушек — товаром ходовым в крестьянском быту, — или писарю, который зарабатывал на жизнь переписыванием бумаг.

Вторая версия связана с письменным трудом, но не торговым, а профессиональным. Перьком могли прозвать переписчика в суде или составителя писцовых книг, где фиксировали земли и угодья для налогообложения. Впрочем, не обязательно быть чиновником: так могли сказать и о простом грамотном человеке, умевшем составить прошение или письмо, что в старой деревне ценилось на вес золота.

Есть и третья, более редкая гипотеза. Она возводит основу к имени Перько — краткой форме таких имен, как Пергет, Перегрин (от латинского «странник, паломник») или Персид (от греческого «персидский»). Имена эти в святцах встречались нечасто, поэтому и версия считается менее распространенной, хотя полностью исключать её нельзя.

Что касается словообразования, то модель проста: суффикс -ов- указывает на принадлежность, то есть «Перькова» буквально означает «дочь или жена Перька». Фамилия закрепилась за потомками человека с таким прозвищем, и со временем форма женского рода стала самостоятельной. Если выбирать между версиями, то профессиональное прозвище от «пера» выглядит правдоподобнее: такие имена-характеристики по роду занятий были массовыми, тогда как редкие календарные имена вроде Перегрина вряд ли дали бы столь устойчивую и простую форму.