Фамилия Перцигер — редкий для России случай, когда корень указывает не на занятие или внешность, а на место жительства, причём с точностью до конкретного топонима. В основе лежит немецкое слово «Berg» (гора) и приставка «Per-», которая в диалектах могла означать «у» или «при». Буквально — «живущий у горы». Но есть нюанс: суффикс «-цигер» нехарактерен для немецких фамилий, он скорее напоминает идишскую или ашкеназскую модель, где к корню прибавляли окончание, обозначающее принадлежность к месту. Поэтому фамилию чаще связывают с еврейским вариантом «Берцигер» (от «Берг» — гора), который при переходе в русскую речь мог утратить «б» и превратиться в «Перцигер» под влиянием местного произношения.

Географически фамилия тяготеет к западным регионам бывшей Российской империи — Волыни, Подолью, Галиции. Именно там, в местечках у Карпат, оседали еврейские общины, и прозвище «тот, кто с горы» было естественным для человека, жившего на отшибе или на холме. В метрических книгах XIX века встречаются варианты написания: Перцигер, Перцикер, Берцигер — путаница возникала из-за того, что писарь записывал фамилию на слух, а в идише звук «г» и «к» на конце иногда не различались.

С социальной точки зрения, Перцигеры в основном были ремесленниками или мелкими торговцами — типичный для еврейского местечка слой. Дворянских корней у фамилии нет, она не попала в родословные книги, зато встречается в списках кантонистов и в документах о переселении в Херсонскую губернию в середине XIX века.

Однокоренных фамилий в русском языке практически нет, но можно провести параллель с немецкой фамилией Бергер (тот же смысл — «горец»). Перцигер — более узкий, локальный вариант, который не стал массовым. Сегодня носителей фамилии мало, и почти все они — потомки выходцев из черты оседлости, сохранившие память о предке, который когда-то жил «у горы».