Основой фамилии Петруненков послужило церковное имя Пётр. Мужское крестильное имя Петр в переводе с древнегреческого означает «камень». В основу же фамилии Петруненков легла уменьшительно-ласкательная форма этого имени — Петруня. Среди покровителей имени - святой Петр, один из учеников Иисуса Христа и первоверховный апостол. Со временем, вероятно, род Петруненко переехал в Россию, где и произошла русификация фамилии путем добавления суффикса -ов. Мужское крестильное имя Петр в переводе с древнегреческого означает «камень». В основу фамилии легла производная форма имени — Петруня. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Петруня, со временем получил фамилию Петрунёнков.