Фамилия Петрунев (а также её вариант написания Петрунёв) восходит к мужскому крестильному имени Пётр. В переводе с древнегреческого оно означает «камень», «скала». В основу фамилии легла не полная, а производная, уменьшительно-ласкательная форма имени — Петруня. Так в старину могли звать и взрослого мужчину, и подростка, подчёркивая тёплое или просто привычное отношение в семье и в окружении.

Модель образования проста и типична для русских фамилий: к основе Петрун- добавили притяжательный суффикс -ев. Первоначально форма Петрунев означала «чей?» — то есть сын, внук или потомок человека по имени Петруня. Со временем притяжательное значение стёрлось, и фамилия закрепилась как наследственная, переходя от отца к детям.

Интересно, что фамилия с таким корнем не единственная. От той же уменьшительной формы Петруня образовались родственные фамилии Петрунин, Петруничев, Петрунькин. А если учесть, что имя Пётр было одним из самых распространённых на Руси, неудивительно, что производных форм и, соответственно, фамилий от него возникло множество: Петров, Петраков, Петрищев, Петрушин. Фамилия Петрунев стоит в этом ряду как одна из «младших» по возрасту — она появилась позже, чем простая отчество Петров, поскольку в основе лежит уже не каноническое имя, а его обиходный вариант.

В написании встречаются оба варианта — Петрунев и Петрунёв. Это связано с тем, что в устной речи под ударением часто произносится «ё», а на письме, особенно в документах прошлых веков, букву «ё» могли заменять на «е». Поэтому обе формы обозначают одну и ту же фамилию, и разница здесь чисто орфографическая, а не смысловая.

Сословной принадлежности у фамилии нет: её могли носить и крестьяне, и мещане, и служилые люди. Всё зависело от того, в какой среде жил предок. Но в любом случае, человек по фамилии Петрунев — это потомок того, кого в своё время ласково или по-простому звали Петруней, а корень уходит к древнегреческому слову, означающему твёрдость и надёжность камня.