Фамилия Петрунецкий — редкий пример, когда польская модель образования фамилии наложилась на русское или украинское имя. На слух она кажется «шляхетской», но на деле могла принадлежать и крестьянину, и мещанину, и священнику. Всё зависит от того, где и когда фамилию дали.

Основа здесь — имя Пётр в его уменьшительной форме. Если бы фамилия строилась по стандартной восточнославянской схеме, мы бы получили Петруненко (в украинском варианте) или Петрунин (в русском). Но суффикс -ецк- (в написании -цк-) выдает польское влияние. В польском языке суффикс -ecki/-icki часто присоединялся к основе для образования фамилий по названию местности: например, Пётр из села Петрунец. Само слово «Петрунец» могло быть названием хутора или деревни, где жил первый носитель фамилии. Такие топонимы нередко возникали от имени владельца или основателя — в данном случае человека по имени Петрунь (ласкательное от Пётр).

Есть и вторая версия, более прозаичная. В Речи Посполитой, а позже и на западнорусских землях, фамилии на -цкий давали не только шляхте, но и духовенству, и зажиточным крестьянам при переписях. Петрунецкий мог возникнуть как «искусственная» фамилия: семинарист или крестьянин взял себе фамилию по имени отца или деда Петруна, прибавив модный тогда польский суффикс. Такой приём был особенно распространён в Беларуси и на Правобережной Украине в XVIII–XIX веках.

Однокоренные фамилии — Петрунин, Петруненко, Петруневич, Петрункевич — встречаются чаще, но именно Петрунецкий сохранил редкую польскую огласовку. Географически фамилия тяготеет к западным областям: встречается в Гродненской, Волынской, Киевской губерниях по дореволюционным записям. В современной России она редка, но не исчезла — единичные носители живут в Москве и Санкт-Петербурге.

Суффикс -цкий в этой фамилии не обязательно говорит о дворянстве. В Российской империи фамилии на -ский давали и выходцам из духовного сословия (семинаристам), и крестьянам, переселившимся в город. Поэтому Петрунецкий — скорее маркер географии и времени, чем социального статуса.