Фамилия Пилишина — женская форма, а её мужской вариант Пилишин. Разберёмся с происхождением мужской основы, от которой она образована.

Модель образования фамилии типична для русского Севера, Сибири и некоторых областей Поволжья. Суффикс -ин указывает на принадлежность: Пилишин — это «сын Пилиши» или, что вероятнее, «человек из семьи Пилиши». Сама основа «Пилиша» — это разговорная, усечённая форма одного из крестильных имён. Скорее всего, от имени Филипп (в просторечии часто звучало как Фили́п, а уменьшительные формы — Филя, Пили́ша). В некоторых говорах начальное «ф» заменялось на «п», что давало варианты вроде Пилип, Пилиша. Таким образом, Пилишин — это «Филиппов», то есть потомок человека по имени Филипп.

Вторая, менее распространённая версия, связывает фамилию с прозвищем. В диалектах «пилить» могло означать не только работу пилой, но и докучать, надоедать, «пилить» кого-то. Прозвище Пилила или Пилиша давали человеку навязчивому, ворчливому. Однако для фамилий на -ин гораздо типичнее происхождение от имени, а не от глагольного прозвища, поэтому версия с именем Филипп выглядит убедительнее.

Фамилия Пилишин (и Пилишина) встречается нечасто. Географически она тяготеет к северным и северо-восточным регионам России — Архангельской, Вологодской, Кировской областям. Это подтверждает и суффикс -ин, который в этих местах был основным способом образования фамилий от имён и прозвищ, в отличие от южнорусских областей, где чаще использовали -ов/-ев.

Таким образом, предок современных Пилишиных, скорее всего, был Филиппом, которого в быту звали ласково или сокращённо Пилиша. Фамилия сохранила эту народную, «домашнюю» форму имени, что делает её живым свидетельством разговорной речи прошлых веков.