Фамилия Пинер — редкая для России, и её происхождение почти наверняка не русское, а западноевропейское. В русском языке нет корня «пин-» в значении, которое могло бы лечь в основу прозвища или имени, а суффикс -ер не характерен для восточнославянских фамилий (у нас типичны -ов, -ин, -ский). Поэтому первое, что приходит в голову: перед нами немецкая или еврейская фамилия, попавшая в русский контекст через миграцию или переселение.

Самый прямой и логичный разбор — от немецкого слова Pinner. В немецком это название профессии: «пиннер» — тот, кто изготовляет булавки, шпильки или наконечники (от Pin — булавка, штырь). Такие фамилии по ремеслу (так называемые профессиональные фамилии) массово возникали в немецкоязычных землях в XIV–XVI веках. Предок-носитель мог быть ремесленником-металлистом, работавшим с мелкими изделиями — булавками, заколками, гвоздями. Это не аристократическое, а вполне цеховое, городское ремесло.

Встречается и другая версия: фамилия может быть топонимической, то есть происходить от названия места. В Германии есть несколько населённых пунктов с названием Pinnow (исторически — Piner), и тогда фамилия указывала бы на выходца оттуда. Однако суффикс -er в немецкой модели как раз и означает «житель такого-то места» (ср. Berliner — берлинец), так что географическое происхождение тоже возможно, но менее вероятно, чем ремесленное: профессии давали фамилии гораздо чаще.

В еврейской среде (ашкеназской) фамилия Пинер могла возникнуть как вариант от названия города Пинск (по-немецки Pinsk произносился бы как «Пинск»), но в таком случае скорее ожидалась бы форма Пинскер или Пинский. Форма Пинер встречается у евреев, но реже и, как правило, как германизированный вариант от Pinner.

В русских документах фамилия Пинер практически не фиксируется до XX века. Скорее всего, она появилась в России вместе с немецкими колонистами (при Екатерине II) или в результате миграций конца XIX — начала XX века. Встречается она и сегодня, но крайне редко — в основном на юге России и в крупных городах, куда в советское время переселялись специалисты немецкого происхождения. Таким образом, если вы носите эту фамилию, ваши предки, вероятнее всего, были ремесленниками-булавочниками из немецких земель, а сама фамилия — прямой перевод профессии на фамильное имя.