Фамилия Пенер — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. В ней нет привычных русских суффиксов -ов, -ин или -ский, что сразу указывает: перед нами не типичная крестьянская или дворянская фамилия центральной России. Скорее всего, она имеет западное или южное происхождение, либо образована от прозвища, которое не связано с отчеством.

Первый и самый вероятный вариант — немецкие или еврейские (ашкеназские) корни. В немецком языке слово «Penner» (произносится почти так же) означает «бродяга» или «бездомный», а в разговорной речи — «зануда», «нытик». Это прозвищная фамилия, которая закреплялась за человеком с определённым характером или образом жизни. В России фамилия Пенер могла появиться среди немецких колонистов, которых приглашала Екатерина II, или среди еврейского населения черты оседлости. В последнем случае написание через «е» (а не через «ё») — обычная адаптация звучания на русский лад.

Вторая версия — тюркская. В турецком и крымскотатарском языках слово «pener» (или «penir») означает «сыр». Тогда фамилия могла закрепиться за торговцем сыром, сыроваром или просто человеком, получившим такое прозвище за любовь к этому продукту. Эта гипотеза слабее, потому что в тюркских фамилиях чаще встречаются аффиксы принадлежности (например, -лы/-ли), а «Пенер» как чистая основа без суффикса — скорее исключение.

Третий вариант, самый редкий, — от диалектного русского слова. В некоторых говорах «пенер» или «пенярь» могли называть ворчуна, привереду (сравните с глаголом «пенять» — упрекать, жаловаться). Но это лишь предположение, не подтверждённое словарями.

География фамилии сегодня размыта: носители встречаются в России, на Украине, в Беларуси и странах Балтии, но нигде не образуют плотных гнёзд. Это подтверждает версию о пришлом, не массовом характере фамилии. В дореволюционных метрических книгах Пенеры изредка фиксировались среди мещан и ремесленников западных губерний. Дворянских родов с такой фамилией не обнаружено.

Итог: если вы встретили фамилию Пенер, скорее всего, её носитель — потомок немецкого или еврейского переселенца, получившего прозвище по характеру или роду занятий. Тюркский «сырный» след менее вероятен, но полностью исключать его нельзя.