Фамилия Пищелко почти наверняка образована от прозвища, а не от имени. В её основе лежит глагол «пищать», и это сразу задаёт два направления для толкования: либо речь о голосе, либо о ремесле.

Самая простая версия — прозвище по голосу. Пищелкой могли называть обладателя тонкого, звонкого, писклявого голоса. Но чаще, судя по логике народных прозвищ, так дразнили крикливого, капризного и непослушного ребёнка, который постоянно «пищал» — то есть ныл или плакал по пустякам. В этом случае фамилия закрепилась за человеком, который в детстве или юности отличался беспокойным нравом.

Вторая версия связана со словом «пищик». Так называли дудочку для подманивания птиц во время охоты. Если принять эту версию, прозвище Пищелко получал либо сам охотник, искусный в подманивании дичи, либо мастер, который такие дудочки изготавливал. Правдоподобность этой гипотезы подкрепляется тем, что прозвища от названий орудий труда и охотничьих приспособлений в русских фамилиях встречаются часто.

Словообразовательная модель здесь типична для украинских и южнорусских фамилий: суффикс -к-о придаёт прозвищу оттенок уменьшительности или принадлежности к носителю признака. Подобным образом строились фамилии вроде Шумилко или Свирилко. Формант -о вместо привычного -а на конце указывает на украинское или белорусское происхождение основы, хотя сама фамилия могла закрепиться и в южнорусских говорах.

Выбор между версиями — голос или ремесло — зависит от того, какой смысл вкладывали в слово в конкретной местности. В говорах, где «пищик» был распространённым охотничьим термином, прозвище скорее относилось к промыслу. Там же, где слово бытовало только в значении «пискун», фамилия отражала характер. Обе версии имеют право на существование, но первая — от крикливого ребёнка — выглядит более универсальной и потому чуть более вероятной.

Отдельного внимания заслуживает написание: фамилия сохранила безударное -е- в корне, что не редкость для прозвищ, записанных на слух. В документах могли встречаться варианты Пищалко или Пищилко, но закрепилась форма Пищелко.