Фамилия Пищёлкин на первый взгляд кажется звукоподражательной или связанной с едой, но её корень лежит в другом месте. Основа фамилии — не «пища», а диалектное слово «пищалка» или «пищёлка». В русских говорах так называли дудку, свирель или любой простой музыкальный инструмент, издающий писк. Скорее всего, прозвище Пищёлка дали человеку, который играл на такой дудке, мастерил их или просто обладал тонким, писклявым голосом. Суффикс -ин- указывает на принадлежность: «чей?» — Пищёлкин, то есть сын или потомок Пищёлки.

Словообразовательная модель здесь классическая для русских фамилий: прозвище на -а/-я (Пищёлка) плюс притяжательный суффикс -ин. В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые чаще образовывались от существительных мужского рода, форма на -ин типична для прозвищ, оканчивающихся на гласный. Это указывает на непринуждённую, бытовую среду возникновения — скорее в крестьянской или ремесленной среде, чем в дворянской.

Интересно, что фамилия Пищёлкин встречается в основном в центральных и северных регионах России, особенно в Вологодской и Архангельской областях, где были сильны традиции народных музыкальных инструментов. Там «пищалкой» могли называть не только дудку, но и берестяной рожок. В южных говорах это слово почти не фиксируется, что делает фамилию регионально маркированной.

Встречается и версия о связи с глаголом «пищать» в переносном смысле — так могли прозвать плаксивого или слишком жалобного человека. Но она менее вероятна: прозвища по инструменту или ремеслу давали чаще, чем по случайной черте характера. К тому же в ономастических работах (например, в словаре русских фамилий Б. Унбегауна) подобные «музыкальные» фамилии — Пищиков, Дудин, Гудков — образуют устойчивую группу, и Пищёлкин встаёт в этот ряд естественно.

Фамилия не относится к числу распространённых, но её носители встречаются в документах XIX века среди государственных крестьян и мещан. В советское время она могла сменить написание на Пищалкин или Пищиков под влиянием канцелярских ошибок, но исходная форма сохранилась именно в северных записях.