Фамилия Плаксионова хранит память о прозвище дальнего предка — Плаксион. Это именование и стало основой фамилии, а его происхождение имеет несколько версий. Самая распространенная из них связывает прозвище с существительным «плакса». В «Толковом словаре живого великорусского языка» В. И. Даля это слово трактуется как «слезливый человек». Скорее всего, так могли назвать капризного ребенка или взрослого, отличавшегося особой эмоциональностью и ранимостью. Прозвище легко закреплялось за человеком в качестве наиболее употребительного именования, а со временем легло в основу фамилии.

Существует и другая гипотеза, выводящая прозвище Плаксион из греческого слова «плакс», что означает «равнина» или «лепешка». Если следовать этой версии, прозвище могло отражать место жительства основателя рода — в местности, где нет гор и больших холмов. Не исключено также, что Плаксион относится к «профессиональным» именованиям, указывающим на род деятельности. В этом случае предок носителя фамилии мог быть пекарем, а само прозвище возникло от названия изделия или процесса.

Сам суффикс -он в прозвище Плаксион не типичен для русских именований, что делает эту фамилию заметной на фоне однокоренных. Сравните с более простыми и частотными образованиями от той же основы: Плаксин, Плаксов. Форма на -он выделяется, и это косвенно поддерживает версию о заимствованной основе, хотя полностью исключать народное переосмысление слова «плакса» нельзя. Правдоподобнее выглядит первая версия — она опирается на живую разговорную традицию и понятную семантику, тогда как греческий след требует допущений о редком заимствовании.

Фамилия Плаксионова образована по стандартной русской модели: к основе Плаксион добавили суффикс -ов, указывающий на принадлежность роду, а затем — окончание -а, свойственное женским формам фамилий. Таким образом, потомок человека с прозвищем Плаксион со временем получил фамилию Плаксионов, а его дочери и жены стали писаться Плаксионовыми. Передаваясь из поколения в поколение, фамилия по сей день хранит память о происхождении человека, и представитель рода Плаксионовых может по праву гордиться ею как ценным источником семейной истории.