Фамилия Плискун — это застывшее в имени прозвище, которое звучит как фонетический вариант более привычного Плескун. Чередование «е» и «и» в корне — не редкость для народной речи, поэтому обе формы жили параллельно, а в документах закрепилась одна из них.

Самую очевидную версию происхождения подсказывает глагол «плескать», «плескаться». В этом случае Плескуном (а позже Плискуном) называли человека, который любил купаться, шумно возиться в воде, брызгаться. Такое прозвище могло закрепиться за ребятнёй или за взрослым, не упускавшим случая окунуться в реке. Версия живая и наглядная, но не единственная.

Более тонкое объяснение отсылает к нарицательному «плёс» — так называют широкий разлив реки между двумя её изгибами или спокойный участок между перекатами. Тогда прозвище Плескун получает «географический» смысл: его давали человеку, жившему неподалёку от такого плёса, на берегу тихой воды. Обе версии имеют право на существование, но вторая выглядит чуть более весомой: прозвища по месту жительства встречаются в русской ономастике чаще, чем прозвища по привычке плескаться.

Суффикс -ун в основе указывает на деятеля: плескун — тот, кто плещет, подобно тому как бегун — тот, кто бегает. Такая словообразовательная модель типична для прозвищ, которые затем превращались в фамилии без дополнительных суффиксов. Фамилия Плискун так и осталась в «чистом» виде, без типичного для русских фамилий окончания -ов или -ин, что говорит о её относительно позднем закреплении или о южнорусском, украинском влиянии, где бессуффиксные фамилии распространены шире.

О точной географии фамилии сказать сложно: она встречается и в России, и на Украине, что подтверждает её народное, диалектное происхождение. В письменных источниках фамилия редкая, известных исторических носителей она не оставила, поэтому строить генеалогическое древо по документам придётся с нуля. Зато сам корень понятен без словаря: и «плёс», и «плеск» — слова, знакомые каждому, кто хоть раз стоял на берегу реки.