Фамилия Плисун — один из тех случаев, когда прозвище говорит о ремесле или занятии предка, причем довольно редком. В основе лежит слово «плис» — так в старину называли разновидность хлопчатобумажного бархата, плотную ворсистую ткань, популярную в народном костюме и быту. Плисом могли обшивать тулупы, шить из него жилеты, шапки, праздничную одежду. Соответственно, плисуном называли мастера, который работал с этой тканью: портного, торговавшего плисом, или того, кто изготавливал плис на ткацком станке.

Суффикс -ун в фамилии типичен для русских прозвищ, обозначающих деятеля по характерному действию или занятию (ср. бегун, крикун, плясун). Однако в данном случае основа не глагольная, а предметная, что встречается реже: «Плисун» — буквально «тот, кто имеет дело с плисом». Такая модель образования (существительное + -ун) в фамилиях закрепилась преимущественно в южнорусских и украинских говорах, поэтому географически фамилия Плисун чаще всего встречается в регионах бывшего Черниговского и Полтавского наместничеств, а также в соседних областях России — Брянской, Курской, Белгородской.

В словарях русских фамилий (например, у Б. Унбегауна) «плис» упоминается как источник нескольких фамилий: Плисов, Плискин, Плис. Форма Плисун стоит несколько особняком — она сохранила не только профессиональное значение, но и разговорный оттенок: «плисун» могло быть насмешливым или уважительным прозвищем мастера, который «возится с плисом». Спорных версий происхождения немного: иногда фамилию пытаются связать с диалектным «плиснуть» (ударить) или с украинским «плис» (плесень), но эти гипотезы слабы — ни первое, ни второе не даёт естественного прозвища для человека, тогда как связь с тканью очевидна и подтверждается бытованием однокоренных фамилий.

Носители фамилии Плисун, судя по архивным записям XIX века, были преимущественно крестьянами и мещанами, работавшими в портняжном или текстильном деле. В метрических книгах Курской губернии встречаются Плисуны, записанные как «мастеровые плисового дела». Фамилия не стала дворянской и не получила широкого распространения за пределами южнорусского региона, что делает её хорошим маркером для генеалогического поиска: если ваши предки — Плисуны, скорее всего, они жили в чернозёмной полосе и занимались ремёслами, связанными с тканями.