Фамилия Плужжников — редкий случай, когда двойная буква в корне не ошибка, а ключ к разгадке. В русских фамилиях на -ов/-ев основа обычно происходит от профессии, прозвища или имени. Здесь основа — «плужжник». Это не опечатка и не вариант фамилии Плужников (от «плуг»). В говорах северных и центральных губерний «плужжником» называли не пахаря, а мастера, который делал плуги — плужного кузнеца или плотника. Двойное «ж» возникло на стыке корня «плуг» и суффикса «-ник»: плуг → плужник (с чередованием г/ж) → в диалектном произношении с долгим, «жж» на слух закрепилось и на письме.

Фамилия образована по продуктивной модели: прозвище по ремеслу + суффикс принадлежности -ов. Плужжников буквально означает «сын плужжника» или «из семьи плужжника». В отличие от массовой фамилии Плужников, которая могла возникнуть в любом земледельческом регионе, вариант с двойным «ж» географически более узок. По данным ономастов, такие формы фиксировались в основном в бывших новгородских и вятских землях, где кузнечное дело было развито, а диалекты сохраняли долгие согласные.

Современное написание с двумя «ж» — нормативное для этой фамилии, хотя в документах XIX века можно встретить и «Плужников», и «Плужжников» у одной семьи. Переписчики часто упрощали двойные согласные, но носители фамилии, как правило, настаивали на точном произношении. С точки зрения словообразования, это типичная «профессиональная» фамилия, но с редкой фонетической приметой, которая сразу выделяет её среди однокоренных.