Фамилия Плюга — редкий случай, когда в основе лежит не прозвище по внешности или характеру, а конкретное действие или состояние. В отличие от более распространённых «Плюгавцев» или «Плюгавых», эта форма застыла в кратком прилагательном или существительном мужского рода. Скорее всего, перед нами древнерусское прозвище, которое дали человеку, склонному плеваться, или тому, кто говорил невнятно, «плевался» словами. Глагол «плюгать» (или «плюгавить») в диалектах означал «брызгать слюной», «плевать», а в переносном смысле — «браниться», «огрызаться».

Фамилия бессуффиксная, что указывает на её раннее происхождение. В XV–XVII веках такие прозвища нередко переходили в фамилии без изменений, особенно в среде крестьян и посадских людей. Модель образования проста: исходное слово «плюга» (плюющийся, бранчливый человек) стало родовым именем. Вариант с суффиксом -ин («Плюгин») встречается чаще, но именно форма «Плюга» сохранила архаичный вид.

Ударение, вероятнее всего, падает на первый слог: Плю́га. Это подтверждается логикой древнерусского ударения в кратких прилагательных. Географически фамилия встречается точечно — в основном в южнорусских областях (Курская, Воронежская, Ростовская), где диалектный глагол «плюгать» был в ходу. Встречаются единичные носители в Беларуси.

Стоит отбросить наивную версию о связи со словом «плюгавый» в значении «невзрачный, жалкий». Это позднее значение, появившееся не раньше XVIII века. Изначально «плюгавый» означало «имеющий привычку плеваться», и лишь со временем приобрело уничижительный оттенок. Таким образом, предок носителя фамилии Плюга — не хилый и болезненный человек, а, скорее, резкий на язык, сварливый или просто неопрятный в разговоре.

Фамилия не имеет отношения к дворянским родам и не фиксируется в старых боярских списках. Это редкий пример крестьянской или мещанской фамилии, которая сохранилась в исходной, не «облагороженной» суффиксом форме.