Фамилия Подакина — женская форма, а её мужской вариант — Подакин. С первого взгляда бросается в глаза суффикс -ин, который в русских фамилиях указывает на принадлежность: «чей?» — «Подакин», то есть сын или потомок человека по прозвищу Подака. Само прозвище Подака — редкое, и его корни стоит искать в диалектах русского языка.

Скорее всего, основа «подак-» связана с глаголом «подакать» или «подакивать», что означало «поддакивать», «соглашаться», «вторить». В северных и сибирских говорах «подака» — это человек, который во всём поддакивает, льстит или просто не имеет своего мнения. Прозвище могли дать как в насмешку, так и по характерной манере поведения. В этом случае фамилия Подакин относится к группе «характерологических» прозвищ, как, например, Молчанов или Говорухин.

Есть и другая, менее очевидная версия. В некоторых говорах «подака» — это не человек, а предмет: например, деревянная колотушка или приспособление для подбивки, подгонки. Если предок занимался плотницким или бондарным делом, такое прозвище могло прикрепиться к нему по инструменту. Однако эта гипотеза слабее, так как в ономастических источниках подобные значения для фамилии Подакин не фиксируются, а «поддакивающий» человек — более типичный для русской прозвищной традиции образ.

Фамилия Подакина встречается в основном в центральных и поволжских регионах России, что косвенно подтверждает её происхождение от живого разговорного прозвища, а не от редкого диалектного слова. Суффикс -ин, а не -ов, указывает на то, что основа прозвища оканчивалась на -а, что типично для прозвищ, образованных от глагольных форм (ср. Гуляка, Заика). Таким образом, предок носительницы этой фамилии, скорее всего, был человеком, которого в деревне прозвали Подакой за привычку во всём соглашаться или поддакивать.