Фамилия Поддукина — женская форма мужской фамилии Поддукин, и её происхождение связано с прозвищем или мирским именем, которое давали человеку с характерной чертой или местом жительства. Основа фамилии — «поддука» или «поддук», слово, которое в русских говорах могло означать человека, живущего «под дубом» или в дубраве. Суффикс «-ин» указывает на принадлежность: Поддукин — «сын Поддуки», то есть потомок человека с таким прозвищем. Такая модель образования типична для русских фамилий, особенно на севере и в центральной России, где фамилии на «-ин» часто происходят от названий профессий, прозвищ или географических объектов.

Вероятнее всего, прозвище «Поддука» возникло как указание на место жительства — у дуба или в дубовом лесу. Дуб в славянской традиции символизировал силу, долголетие и связь с предками, поэтому такое прозвище могло быть уважительным или просто описательным. В некоторых говорах «поддука» могло означать и человека, который «под дубом сидит», то есть ленивого или задумчивого, но это менее распространённая версия. В ономастических трудах, например в работах Б. Унбегауна, фамилии с корнем «дуб» и его производными (Дубин, Дубов, Поддубный) хорошо известны, и Поддукина органично вписывается в этот ряд, хотя её форма с суффиксом «-к-» встречается реже.

Географически фамилия Поддукина, судя по данным переписей и архивов, встречается в основном в центральных и северных регионах России, особенно в Вологодской, Архангельской и Костромской областях. Это подтверждает версию о происхождении от местности с дубовыми рощами — такие леса были распространены в средней полосе, но на севере дуб редок, поэтому прозвище могло быть принесено переселенцами. Носители фамилии в прошлом чаще всего были крестьянами или ремесленниками, жившими в лесной зоне, и их прозвище могло закрепиться как родовая метка, передававшаяся по наследству.

Встречается также вариант фамилии с ударением на второй слог — Подду́кина, что может указывать на диалектные особенности произношения. Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то Поддукин стоит в одном ряду с Поддубным и Поддубским, но суффикс «-к-» делает её более разговорной, «народной», без книжного оттенка. Для тех, кто носит эту фамилию, она может быть напоминанием о предке, жившем в лесу, или о человеке, которого в деревне называли по месту его дома — у дуба.