Фамилия Подлипаева происходит от прозвища Подлипай. В основе, скорее всего, лежит слово «липа», но объяснений этому несколько, и они ведут в разные стороны.

Самая прямая версия — географическая. Так могли назвать человека, который жил в липовом лесу или рядом с почитаемой липой. У южных славян, например у словенцев, липа в центре села была традиционным местом сбора молодёжи. В день св. Флориана там зажигали костры, вели разговоры, а после обхода села разносили новый огонь по очагам. Реальные почитаемые липы у южных славян существовали до самого недавнего времени. Дерево считалось счастливым: его не боялись сажать у домов и даже на могилах. В таком случае прозвище Подлипай закреплялось за человеком по месту жительства — «тот, кто под липой».

Но у слова «подлипать» в русском языке есть и переносный смысл. Нельзя исключать, что прозвище отражало характер: так могли сказать про навязчивого, прилипчивого человека или льстеца, который «подлипает» к нужным людям. Эта версия не менее правдоподобна, особенно если вспомнить, что прозвища часто давались не по доброй воле, а по заметной черте поведения.

Словообразовательная модель здесь простая и типичная для русских фамилий: прозвище Подлипай + патронимический суффикс -ев (после мягкого согласного) + родовое окончание -а. То есть фамилия отвечает на вопрос «чей?» — сын Подлипая. Потомок человека с таким прозвищем со временем и получил фамилию Подлипаева.

Какая из двух версий вернее — сказать трудно. Обе имеют право на существование, и, возможно, в разных семьях фамилия возникла независимо и по разным причинам. Но если судить по частотности, то прозвища по месту жительства в русской ономастике встречаются реже, чем прозвища по характеру, поэтому версия о «льстеце» выглядит чуть более вероятной.