Фамилия Подорогина образована от мужского прозвища Подорога. Суффикс -ин указывает на принадлежность: Подорогин — «сын Подороги». В основе лежит сочетание «по дороге» или «подорога». Скорее всего, так называли человека, которого часто встречали в пути, бродягу, путника или того, кто жил у дороги. В говорах слово «подорога» могло означать и попутчика, и человека без постоянного крова.

Менее вероятна, но возможна версия, что прозвище дали по месту жительства — за дорогой. Тогда «подорога» — это участок земли или дом, расположенные прямо у проезжей части. В русской ономастике такой способ именования типичен: по характерному признаку или занятию человека.

Фамилия фиксируется преимущественно в центральных и южных регионах России, особенно в бывших владениях Рязанского княжества. Встречается в документах XVII века, где упоминаются крестьяне и посадские люди с прозвищем Подорога. Сословно фамилия неэлитная: её носили в основном крестьяне и мещане, что подтверждает бытовое, а не служилое происхождение.

Обратите внимание на редкий суффикс -ин в сочетании с основой на -а. По модели образования Подорогина стоит в одном ряду с фамилиями типа Дорогин, Путилин, Тропинин — все они восходят к словам, связанным с дорогой или передвижением. Но если Дорогин происходит от имени Дорога (сокращение от Дорогаев), то Подорогина — именно от прозвища, описывающего положение или поведение человека.