Фамилия Пограничная образована от прозвища Пограничный, которое восходит к аналогичному прилагательному «пограничный» - «расположенный, находящийся вдоль границы, у границы». Согласно этому, можно предположить, что основатель рода Пограничных проживал на границе между двумя государствами или занимался охраной границы. Это были притяжательные прилагательные с суффиксами –ов /-ев, -ая, изначально указывающие на прозвище отца. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Пограничный, со временем получил фамилию Пограничная.