Фамилия Полога — редкий случай, когда основа слова не даёт однозначной подсказки. С первого взгляда напрашивается связь с прилагательным «пологий» (отлогий, покатый), но в русской ономастике это почти не встречается. Куда вероятнее, что перед нами не прилагательное, а существительное, и корень здесь другой.

Слово «полог» в древнерусском языке означало занавес, покрывало, шатёр. В этом значении оно закрепилось и в современных диалектах: пологом называли навес над кроватью, балдахин или даже отдельную комнату-клеть в избе. Прозвище Полога могли дать ткачу, торговцу тканями или человеку, который изготавливал такие занавеси. Либо, по более старой версии, — тому, кто жил в отдельной «пологе» (половине дома), то есть держался особняком.

Суффикс -а в фамилии нестандартен. В русской модели фамилии на -а обычно женские (Кузнецова, Иванова), но Полога — мужская, причём без патронимического суффикса (-ов, -ин). Это указывает на то, что фамилия могла закрепиться в форме прозвища, которое не переделывали в притяжательное прилагательное. Такой тип — «чистое» прозвище в именительном падеже — встречается реже всего и характерен для северных и сибирских говоров, где фамилии нередко записывали прямо по прозвищу отца, без суффикса.

В украинском языке слово «полога» значит «роженица», но эта версия маловероятна для русской фамилии: слишком узкое и ситуативное значение. Скорее всего, предок носителя фамилии был либо ремесленником, либо просто получил бытовое прозвище от слова «полог» — в значении «занавес» или «укрытие». Географически фамилия встречается в основном в центральных и южных областях России, что косвенно подтверждает связь с диалектным ремесленным термином, а не с географическим термином «пологий» (который чаще дал бы фамилию Пологин).