Фамилия Полуяхтов образована от имени собственного и относится к распространенному типу русских фамилий. Основой фамилии Полуяхтов послужило церковное имя Полиевкт. Фамилия Полуяхтов восходит к каноническому мужскому имени Полиевкт, которое в переводе с греческого означает «долгожданный». В русских говорах это имя претерпело значительные изменения: среди его разговорных форм были Полиэкт, Полуэкт, Полуякт, Полуяхт. Последняя и послужила основой при образовании фамилии. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Полуяхт, со временем получил фамилию Полуяхтов. О точном месте и времени возникновения фамилии Полуяхтов в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Полуяхтов представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.