Фамилия Помигалов происходит от прозвища Помигало, которое дали человеку по особенности поведения или характера. В основе лежит глагол «помигать» — то есть «моргать, быстро опускать и поднимать веки». Такое прозвище могло закрепиться за двумя противоположными типами людей: либо за общительным и весёлым, кто живо выражал эмоции мимикой и движением глаз, либо, наоборот, за робким и застенчивым, кто часто моргал от смущения.

Но есть и другая, менее очевидная версия. В псковских говорах тот же глагол «помигать» означал «очень быстро пойти». Если принять эту трактовку, прозвище Помигало описывало не манеру общения, а скорость и ловкость: так могли назвать проворного, расторопного человека, который всё делал быстро и споро. Обе версии сводятся к одному — прозвище отражало живую, заметную черту основателя фамилии, за которую его и выделили среди других.

Фамилия образована по типичной для славян модели: прозвище Помигало + суффикс принадлежности -ов. Суффикс здесь указывает на родство: Помигалов — это «сын Помигалы», потомок человека с таким прозвищем. Такая схема — одна из самых распространённых в русских фамилиях, она закрепилась в основном в центральных и северных регионах России.

Интересно, что фамилия сохранила внутреннюю форму прозвища: она буквально «рассказывает», каким был её первый носитель. В отличие от фамилий, образованных от крестильных имён, которые часто затемняют смысл, здесь прозвищная основа читается прозрачно.

Стоит оговориться: окончательно утверждать, что все Помигаловы происходят из одного места или от одного человека, нельзя. Формирование фамилий шло долго и независимо в разных местностях, поэтому одно и то же прозвище могло возникнуть в разных семьях параллельно. Точное время и место появления конкретной ветви Помигаловых можно установить только через серьёзные генеалогические изыскания — работу с метрическими книгами, ревизскими сказками и другими архивными документами.