Фамилия Прихоженко напрямую связана с прозвищем Прихожий. Так на Руси называли человека пришлого, прибывшего в селение из другой местности. В условиях, когда большинство жило оседло, а принадлежность к общине значила много, прозвище «Прихожий» быстро и точно выделяло новосела. Позже оно закрепилось как наследственное имя и полностью заменило прежнее в быту и официальных бумагах.

Словообразовательная модель здесь простая и прозрачная. К основе «прихож-» добавили суффикс «-енко», который в украинской и южнорусской традиции означает «сын» или «потомок». То есть Прихоженко — буквально «сын Прихожего». Такая модель массово распространилась в XVII–XVIII веках на землях современной Украины и в южных регионах России, откуда фамилия и пошла.

Интересно, что прозвище Прихожий не стоит путать с фамилией Приходько или Приходов. Последние восходят к слову «приход» — и церковному округу, и к акту прихода как таковому. Прихоженко же — это всегда о человеке, который «пришёл» откуда-то, а не о том, кто живёт при церкви. Хотя в народном сознании эти значения иногда смешивались, ономастика разводит их довольно чётко.

В документах фамилия встречается в вариантах Прихоженко, Прихоженков, а также с ударением на втором или третьем слоге. Такая вариативность типична для фамилий, которые долго бытовали в устной традиции до фиксации в метрических книгах. Носители фамилии сегодня рассеяны по всей России и Украине, но чаще всего встречаются в областях, исторически связанных с Запорожским казачеством и Слобожанщиной — там, где переселенческий поток был постоянным явлением.