Фамилия Прохера — редкий случай, когда в основе лежит не имя и не ремесло, а живая, почти грубая характеристика человека. Слово «прохера» в русских говорах имело несколько значений, и все они — о людях с непростым характером. В словарях Даля и областной лексики «прохера» — это пройдоха, ловкач, проныра, тот, кто умеет «пройти» везде и обвести любого вокруг пальца. В некоторых регионах так называли беспокойного, суетливого человека, а порой и бесстыжего, наглого.

Фамилия образована без типичного суффикса (-ов, -ин) — по модели, характерной для украинских и южнорусских фамилий, где прозвище переходило в наследственное имя в чистом виде. Поэтому сразу ясно: предок носителя фамилии был не просто «Прохерой», а человеком, которого так прозвали за сметливость, хитрость или излишнюю бойкость. В отличие от фамилий на -ов (Прохеров), которые могли бы означать «сын Прохера», форма Прохера говорит о том, что прозвище закрепилось за самим родоначальником.

Встречается фамилия в основном на юге России, в Ростовской области, Краснодарском крае, а также на Украине. В писцовых книгах XVII века похожие прозвища фиксировались у казаков и посадских людей — среда, где ценились не родовитость, а личная хватка. Дворянских родов с такой фамилией не известно, что подтверждает её простонародное происхождение.

Спорных версий немного. Иногда фамилию ошибочно связывают с именем Прохор, отсекая окончание. Но это маловероятно: от Прохора естественнее образовались бы Прохоров или Прохорин, а не Прохера. Скорее всего, перед нами случай, когда прозвище пережило имя, от которого его пытаются произвести.

В современном русском языке слово «прохера» почти исчезло, но фамилия осталась — как память о предке, который, судя по всему, умел добиваться своего не силой, а изворотливостью.