Фамилия Пронягин образована от имени Проняга — так в старину в быту называли человека, носившего одно из крестильных имён греческого происхождения. Чаще всего это была уменьшительная форма имён Прокл, Прокопий, Протасий или Прохор. Каждое из них имело своё значение: Прокл — «минувшая слава», Прокопий — «преуспевающий», Протасий — «передовой», а Прохор — «запевала, руководитель хора». В повседневной речи такие длинные имена сокращали до коротких и удобных форм, и Проняга — одна из них.

Словообразовательная модель фамилии проста и прозрачна: к основе Проняга добавили суффикс -ин, который указывает на принадлежность. В русской традиции фамилии с суффиксом -ин обычно возникали от имён и прозвищ, оканчивающихся на -а или -я, и отвечали на вопрос «чей?». Таким образом, Пронягин буквально означает «сын Проняги», «потомок Проняги». Со временем потомки человека по имени Проняга закрепили за собой это обозначение как наследственную фамилию.

Интересно, что имя Проняга не было редкостью в северных и центральных русских землях, где формы на -яга встречались особенно часто. Подобные имена и прозвища несли оттенок простоты и близости, поэтому фамилия Пронягин, скорее всего, имеет крестьянское или посадское происхождение, а не дворянское. Среди однокоренных фамилий можно вспомнить Проняев, Проняков, Пронин — все они восходят к тем же основам, но с разными суффиксами, что отражает региональные особенности словообразования.

Несмотря на кажущуюся простоту, за фамилией стоит целый пласт истории русских личных имён. В документах XVI–XVII веков встречаются люди с именем Проняга, и каждый из них мог стать родоначальником отдельной ветви. Сегодня фамилия Пронягин сохраняет память о том, как когда-то давно человека с греческим крестильным именем окружающие называли по-своему, по-домашнему, и это прозвище пережило века.