Фамилия Прудниченкова — женская форма от Прудниченков, и её разбор стоит начать с суффиксальной цепочки, которая сразу выдаёт географию и время возникновения. Основа здесь — «прудник», то есть человек, живущий у пруда или следящий за ним (смотритель, владелец пруда, либо тот, кто разводил в нём рыбу). Суффикс «-енк(ов)» — характерная черта восточноукраинских и южнорусских фамилий, особенно распространённых на Слобожанщине (современные Харьковская, Сумская, Белгородская области). В отличие от стандартного русского «-ов» (Прудников), форма на «-енко» указывает на уменьшительное или патронимическое значение: Прудниченко — «маленький Прудник» или «сын Прудника». А притяжательный суффикс «-ов» в окончании (Прудниченков) — это уже русификация украинской основы, типичная для XIX–XX веков, когда фамилии адаптировали под русские паспортные стандарты.

Таким образом, Прудниченкова — фамилия не древняя, а сформировавшаяся в крестьянской или казачьей среде не раньше второй половины XVIII века. Её носительницы — потомки человека, которого в своё время прозвали Прудниченко. Само прозвище Прудник могло относиться и к профессии (например, к мельнику, использующему пруд), и к месту жительства (дом у пруда), и даже к характеру — в некоторых говорах «прудником» называли упрямого или медлительного человека. В словаре русских фамилий Б. Унбегауна форма на «-енко» описана как типично украинская, но с оговоркой: в южнорусских губерниях она тоже бытовала, особенно у однодворцев и государственных крестьян.

Что отличает Прудниченкова от более частых Прудниковых — именно двойная суффиксация. Если Прудников образован напрямую от «прудник» + «ов», то здесь сначала сделали уменьшительное «Прудниченко» (как «сын Прудника»), а потом добавили русский патронимический суффикс. Такая модель встречается реже и говорит о смешанной этнической среде: украинский корень, русское оформление. В метрических книгах XIX века фамилия могла писаться и как Прудниченко, и как Прудниченков, и даже Прудниченкова — для женщин.

Сегодня Прудниченкова — редкая фамилия. Её можно встретить в Белгородской, Воронежской, Ростовской областях, а также среди потомков переселенцев на Дальнем Востоке и в Сибири. Никаких знаменитых носителей, прославивших фамилию, в открытых источниках нет — это типичная фамилия сельского населения, не попавшая в дворянские родословные книги. Дворянский герб к ней не прилагается, зато есть прямая связь с прудом: предки тех, кто носит эту фамилию, скорее всего, жили возле воды и занимались нехитрым хозяйством — ловили рыбу, держали уток, брали воду для полива.