Фамилия Пучинин образована от прозвища Пучина — так в старину называли человека, чей характер или образ жизни давал повод для сравнения с этим словом. У В. И. Даля пучина — это «водоверть, водоворот, сувой, водокруть, вир, заверть, суводь, сулой, вороть, крутень, закрутень, выбивающий воды из бездны или поглощающий их». Проще говоря, место, где река бурлит, затягивает и не даёт спокойно плыть.

Самая прямая версия: прозвище Пучина получил тот, кто жил у реки с сильным течением, у омута или водоворота. Такая привязка к месту — частый способ именования в русских деревнях, где люди легко узнавали друг друга по деталям ландшафта. Однако не менее вероятно, что Пучиной называли человека с бурным, своенравным нравом — того, кто «кипит», как вода в водовороте. Это объяснение правдоподобно, потому что прозвища, отражающие характер, всегда были в ходу.

Есть и третье, менее очевидное значение. В народной речи слово «пучина» означало также «брюхо», отсюда выражение «набить пучину», то есть плотно поесть. В этом случае прозвище могло закрепиться за человеком с большим животом. Полнота на Руси долго считалась признаком здоровья и достатка, так что обидного в таком прозвище не видели.

Фамилия Пучинин построена по типичной модели с суффиксом -ин, который присоединяли к основам на -а: Пучина → Пучинин. Такой способ словообразования указывает на прямое родство: Пучинин — это «сын Пучины». Аналогично устроены фамилии Ветров, Вихрев, Бурнин, но у Пучинина есть своя особенность: основа многозначна, и какая из версий верна для конкретной семьи, теперь уже не узнать.

К какому сословию принадлежали первые Пучинины, сказать трудно. Фамилия встречается и в крестьянской, и в мещанской среде, а её распространение не ограничено одной областью — корень «пуч-» встречается в разных говорах, от северных до южных. Возможно, в каждом регионе прозвище возникало самостоятельно, независимо от других.