Фамилия Пунанова образована от прозвища Пунан. Оно восходит к нарицательному «пуня» , что означает «сарай для хранения мякины, сена», «кладовка, клеть для хозяйственных надобностей». Вероятно, такое прозвище содержит указание на социальное положение и род занятий основателя фамилии. Скорее всего, он был крестьянином, который по необходимости проводил много времени в сарае, занимаясь домашними делами. Согласно другой версии, прозвище Пунан восходит к глаголу «пунить» - «говорить вздор». В этом случае так могли прозвать болтуна. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Пунан, со временем получил фамилию Пунанова.