Фамилия Пунанов образована от личного прозвища Пунан, которое, в свою очередь, восходит к нарицательному «пуня». В старых говорах так называли сарай для хранения сена или мякины, а также кладовку, клеть для хозяйственных нужд. Скорее всего, прозвище содержало указание на род занятий предка: он был крестьянином, который много времени проводил в сарае, занимаясь домашними делами. Такая версия выглядит правдоподобной, поскольку подобные «хозяйственные» прозвища были широко распространены в сельской среде.

Согласно другой версии, прозвище Пунан связано с глаголом «пунить», что означает «говорить вздор». В этом случае прозвище могли дать болтуну или пустослову. Эта гипотеза менее убедительна, так как глагол имеет более узкое и менее употребительное значение, тогда как «пуня» — конкретный предмет крестьянского быта, который чаще становился основой для прозвищ.

Словообразовательная модель фамилии проста и типична для русского ономастикона: к основе Пунан присоединился патронимический суффикс -ов, который указывает на принадлежность потомку человека с таким прозвищем. Таким образом, Пунанов буквально означает «сын Пунана».

Интересно, что фамилия могла возникнуть в северных и центральных губерниях России, где слово «пуня» было особенно употребительным. В южных регионах чаще использовали другие термины для обозначения хозяйственных построек, что делает фамилию своеобразным маркером возможного географического происхождения рода.

О точном месте и времени возникновения фамилии говорить сложно: процесс формирования русских фамилий растянулся на несколько столетий, и письменные источники по таким «бытовым» прозвищам часто скудны. Тем не менее, фамилия Пунанов сохранила следы народной речи и хозяйственного уклада прошлого, что делает её ценным памятником славянской культуры и письменности.