Фамилия Пупкиянц сразу обращает на себя внимание необычным сочетанием корня и окончания. Если не вглядываться, можно решить, что перед нами типичная русская фамилия от слова «пупок». Но суффикс -янц выдает армянское происхождение. Это окончание указывает на принадлежность к роду или месту (патронимический суффикс, аналогичный русскому -ов/-ев). В армянском языке -янц — это форма множественного числа родительного падежа, то есть буквально «из рода таких-то». Встречается она в основном у западных армян и в диаспоре, тогда как в восточноармянском варианте чаще пишут -ян.

Корень «Пупк» — вот главная загадка. В русском языке «пупок» — часть тела, но в качестве прозвища это было бы странно для армянина. Скорее всего, мы имеем дело с искажением исходной армянской основы при записи фамилии в российских документах XIX–XX веков. Вероятнее всего, первоначально фамилия звучала как Пупкян или Пупкянц, а корень восходит к армянскому слову «пуп» (բուբ) — «клубок», «узел», или к диалектному «пупк» — «почка», «бутон». В таком случае прозвище могло относиться к внешности (круглый, плотный человек) или к ремеслу (например, ткач, работающий с узлами). Есть и менее правдоподобная версия: связь с турецким «bubik» — «кукла», что могло быть ласковым именем для ребенка.

Географически фамилия Пупкиянц встречается редко, в основном на юге России и в странах бывшего СССР, куда переселялись армяне в ходе миграций. В самой Армении она почти не зафиксирована, что подтверждает версию о записи «на слух» русским чиновником. Интересно, что в некоторых документах XIX века встречается написание Пупкянц — без лишней «и», что ближе к армянской фонетике. Таким образом, носитель фамилии Пупкиянц, скорее всего, потомок армянского ремесленника или крестьянина, чью фамилию адаптировали к русскому произношению, добавив гласную для удобства чтения.