Фамилия Пупляева — один из тех случаев, когда внешняя простота обманчива. На первый взгляд, корень «пупл» наталкивает на мысль о слове «пупок» или «пуп». Однако это лишь первая, самая поверхностная версия, и она не самая убедительная.

Словообразовательная модель фамилии указывает на её происхождение от прозвища или мирского имени. Суффикс -ев (под ударением — -ёв) в женском варианте Пупляева означает, что исходная мужская форма — Пупляев. Такая модель типична для русских фамилий, образованных от основ на мягкий согласный или шипящий. Основа «Пупл» — редкая и нестандартная. Вероятнее всего, она восходит к древнерусскому глаголу «пупить» или диалектному слову «пупля», которое в некоторых говорах означало нечто выпуклое, круглое, вздутое. В этом случае прозвище Пупля могли дать человеку с заметной внешностью — полному, с круглым лицом или, напротив, низкорослому и плотному.

Менее вероятная, но не исключённая версия — связь с именем или прозвищем Пупло, которое могло быть производным от канонического имени Павел (через народные формы Павло, Папуля). Однако такая цепочка («Павел → Папуля → Пупля») слишком натянута и не подтверждается устойчивой народной традицией. В словарях русских фамилий (например, у Б. Унбегауна) подобные формы не фиксируются как типичные.

Географически фамилия Пупляева встречается крайне редко, что говорит о её локальном происхождении — скорее всего, в одном из южнорусских или поволжских регионов, где были распространены диалектные слова с корнем «пуп». Никаких сведений о дворянском или купеческом происхождении этой фамилии нет — она явно крестьянская или мещанская, образованная от бытового прозвища, которое давали по внешнему признаку или манере поведения.

Таким образом, Пупляева — фамилия-прозвище, и её носители, скорее всего, происходят от человека, которого в деревне прозвали Пупля за круглоту, плотность или какую-то иную особенность, связанную со старым значением корня «пуп». Единственная зацепка для более точного выяснения — обращение к местным говорам тех областей, где фамилия встречается сегодня.