Основой фамилии Пупляков послужило мирское имя Пупляк. Мирское имя Пупляк, вероятно, восходит к украинскому диалектному нарицательному «пуплях», что значит «почка цветка или дерева» либо «молодой огурец». Возможно, это имя содержало в себе пожелание, чтобы ребёнок рос, как молодой побег или лист из почки. Вообще до введения на Руси христианства наречение ребёнка именем, представляющим собой название животного или растения (либо части растения), было очень распространённой традицией. Давая младенцу такое имя, как Пупляк, родители хотели, чтобы природа воспринимала ребёнка как своего, чтобы к нему перешли те полезные качества, которыми наделена почка или огурец. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Пупляк, со временем получил фамилию Пупляков.