Фамилия Путаракин — редкая, но прозрачная по происхождению. Её основа — прозвище или нецерковное имя Путарака, а в основе этого прозвища, скорее всего, лежит глагол «путать» или существительное «путаник» (тот, кто путает, сбивает с толку, запутывает дело или следы). Суффикс -ак в русских прозвищах часто обозначает носителя признака (ср. «простак», «гуляка», «злопыхатель»), так что Путарака — человек, склонный к путанице, неразберихе, либо же тот, кто сам живёт в беспорядке.

Модель образования типична для русских фамилий на -ин: от основы на -а/-я (Путарака) прибавляется притяжательный суффикс, обозначающий «чей сын» или «чей человек». То есть Путаракин буквально — «потомок Путараки». Фамилия могла закрепиться в среде крестьян или посадских людей, где прозвища давались по поведению, характеру или бытовым привычкам.

Интересно, что в говорах слово «путара» могло иметь и более конкретное значение — так иногда называли человека, который путает нитки при прядении или вязании, то есть нерадивого прядильщика. В этом случае фамилия могла возникнуть в ремесленной среде, связанной с текстильным производством. Однако это лишь региональная версия, не подтверждённая широкой фиксацией.

С точки зрения географии, фамилия встречается в основном в центральных и северных областях России, но нечастотна. По данным современных телефонных справочников и баз, Путаракины единично представлены в Кировской, Вологодской и Нижегородской областях — зонах, где хорошо сохранились древние прозвищные фамилии на -ин.

В написании нет вариаций: ударение, по аналогии с другими фамилиями на -акин, падает на последний слог — Путара́кин. Никакой связи с татарскими или финно-угорскими корнями не прослеживается, несмотря на необычное звучание — перед нами исконно русская словообразовательная модель, где корень «пут-» (от «путать») и суффикс -ар- образуют прозвище по действию.