Фамилия Путаракина — женская форма, а мужская, Путаракин, образована по самой частотной русской модели: от основы на согласный с помощью суффикса -ин. Это значит, что в основе лежит прозвище или имя, оканчивающееся на -а или -я, — Путарака. Сама же основа звучит необычно: сочетание «путар» встречается в русских говорах крайне редко, и именно эта редкость даёт ключ к происхождению.

Скорее всего, прозвище Путарака связано с диалектным глаголом «путарить» — в некоторых областях (например, в архангельских и вятских говорах) так говорят о невнятной, сбивчивой речи, бормотании, а также о путанице в делах или мыслях. Соответственно, Путаракой могли прозвать человека неразборчивого в словах, путаного в объяснениях или просто рассеянного. Менее вероятна, но возможна связь с «путаром» — так в отдельных местностях называли нечто вздутое, разбухшее (от «пучить»), и тогда прозвище могло относиться к внешности.

По суффиксу -ака (Путарак-а) видно, что прозвище носило экспрессивный, оценочный характер: такие образования часто давали по заметной, необычной черте — смешной, досадной или просто яркой. В этом смысле Путаракина — фамилия из разряда «говорящих», она прямо указывает на свойство предка, а не на его профессию или место жительства.

Фамилия встречается очень локально. Основной ареал — Кировская область и прилегающие районы Вятки. Это подтверждает диалектную природу основы: именно в вятских говорах слово «путарить» фиксируется лексикографами. За пределами этого региона фамилия практически не встречается, что делает её ярким маркером вятского происхождения носителей.