Фамилия Пузекин образована от прозвища или нецерковного имени Пузека. Основа здесь — слово «пузо», которое в древнерусских говорах имело не только прямое значение «живот, брюхо», но и переносное: так могли назвать упитанного, дородного человека, а иногда и того, кто любил плотно поесть. Суффикс -ек- в основе Пузек- указывает на уменьшительно-ласкательную или пренебрежительную форму: Пузека — это «пузатенький», «небольшой, но с брюшком». Такие прозвища были распространены в крестьянской среде, где внешние приметы часто становились основой для фамилий.

Модель образования типична для русских фамилий: к основе на -а (Пузека) добавляется притяжательный суффикс -ин. Фамилия Пузекин буквально означает «сын или потомок Пузеки». Это указывает на то, что предок носителя фамилии был известен в своей общине именно под этим прозвищем. Интересно, что фамилия не получила широкого распространения и встречается в основном в центральных и южных регионах России, что говорит о её локальном происхождении — возможно, из одной-двух деревень, где прозвище закрепилось за целым родом.

В отличие от более частых фамилий на -ов/-ев (Пузов, Пузанов), форма с суффиксом -ин встречается реже. Это может указывать на то, что основа Пузека была не просто прозвищем, а личным именем, которое в некоторых говорах давали детям как обережное — считалось, что имя, связанное с сытостью и здоровьем, принесёт ребёнку удачу и силу. Таким образом, Пузекин — не просто указание на комплекцию предка, а возможный отголосок народной традиции имянаречения.