Фамилия Пятунина восходит к прозвищу Пятуня. Скорее всего, так могли прозвать пятого ребенка в семье. Не исключено также, что фамилия Пятунина восходит к имени Пятуня - производной форме мужского имени Петр (в переводе с др.греч. в данном случае чередование е/я в основе имени связано с влиянием акающих говоров русского языка. В таком случае основатель рода Пятуниных мог быть выходцем из рабочей или крестьянской среды. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Пятуня, со временем получил фамилию Пятунина.