Фамилия Пятун — редкий пример, где основа и суффикс не слились в привычное «-ов» или «-ин», а сохранили первоначальный вид прозвища. В ней нет родового окончания, она застыла в форме, в которой её дали первому носителю. Такие «нестандартные» фамилии чаще встречаются на западе и юге России, в украинских и белорусских землях, где суффикс -ун был активным словообразовательным элементом.

Корень здесь — «пят-», который отсылает к числительному «пять» или глаголу «пятить(ся)». Прозвище Пятун могли дать по разным причинам. Самая прямая версия: пятый ребёнок в семье или человек, родившийся в пятницу. Но суффикс -ун в русских говорах часто указывал на деятеля, склонного к какому-то действию. Отсюда вторая версия: Пятун — тот, кто «пятится», то есть упрямец, не желающий идти вперёд, или, наоборот, осторожный, отступающий человек. В некоторых диалектах «пятуном» называли задом наперёд идущего или того, кто пятит, толкает назад.

Менее вероятна, но возможна связь с диалектным словом «пятун» — так в псковских и тверских говорах могли называть петуха (от звукоподражания «пя-ту»). В этом случае фамилия превращается в «птичье» прозвище, аналогичное Петухов, но образованное по другой модели.

Фамилия Пятун не получила широкого распространения и не вошла в массовые списки дворянских или купеческих родов. Её носители — скорее всего, выходцы из крестьянской или мещанской среды, где прозвища закреплялись за семьёй без переоформления в стандартные фамилии на -ов. Сегодня Пятунов можно встретить в Беларуси, на Смоленщине и в восточных регионах Украины — там, где сохранилась эта словообразовательная архаика.