Фамилия Пятунин восходит к прозвищу Пятуня. Скорее всего, так могли прозвать пятого ребенка в семье. Не исключено также, что фамилия Пятунин восходит к имени Пятуня, производная форма мужского имени Петр (в переводе с др.греч. В таком случае основатель рода Пятуниных мог быть выходцем из рабочей или крестьянской среды. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Пятуня, со временем получил фамилию Пятунин.