Фамилия Петунина образована от прозвища Петуня, которое восходит к слову «петун» - во многих говорах так называют петуха. Скорее всего, такое прозвище получил задиристый человек, забияка, драчун или гордец, то есть напоминавший поведением петуха. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Петуня, со временем получил фамилию Петунина.