Фамилия Пыпкина, несмотря на всю свою редкость, имеет прозрачную этимологию, которая уводит нас в мир русских диалектов. В её основе лежит слово «пыпка» — так в некоторых говорах, особенно на севере и северо-западе России, называли пупок, бутон цветка или небольшой нарост на теле. Соответственно, прозвище Пыпка могли дать человеку маленького роста, с заметной родинкой или просто ласково — как «почку», «росток», что-то небольшое и своё.

Модель образования фамилии классическая для русского севера и центра: прозвище Пыпка плюс притяжательный суффикс -ин, означающий «чей?» — «сын Пыпки». Это типичная «семейная» фамилия, которая закрепилась за потомками конкретного человека. Аналогов по схеме много: Пупкин (от «пуп»), Цветков (от «цветок»), но Пыпкина стоит особняком из-за диалектного корня, который за пределами родных мест мог казаться странным или забавным.

Интересно, что фамилия почти не встречается в центральных и южных регионах России. Основные очаги её бытования — Архангельская, Вологодская и Кировская области, то есть территории, где сохранилось древнее новгородское влияние. В этих краях слово «пыпка» было в ходу, и прозвище не звучало дико. Поскольку фамилия редкая, она могла возникнуть в одном-двух локальных гнёздах и распространиться оттуда, а не появляться независимо в разных местах.

Версия о связи с глаголом «пыпать» (пытать, пробовать) или с тюркскими корнями выглядит натянутой и не находит подтверждения в ономастических словарях. Слово «пыпка» — исконно славянское, родственное общеславянскому *pъpъ (пупырь, пупок), и именно оно даёт наиболее прямую и логичную основу для прозвища. Так что предки носительницы фамилии Пыпкина, скорее всего, жили на Русском Севере, и родоначальник получил своё прозвище за какую-то «маленькую» особенность — будь то рост, привычка или внешняя деталь.