Фамилия Рахимжонов — классический пример фамилии, образованной по восточной модели, но с русским суффиксом, что выдаёт её позднее оформление в документах Российской империи или СССР. В основе лежит арабское имя Рахимжон, которое распадается на две части: «Рахим» (милостивый, один из эпитетов Аллаха) и «жон» (душа, жизнь в персидском и тюркском значении). Полное имя Рахимжон буквально означает «милостивая душа» или «душа Всемилостивого», что типично для составных мусульманских имён, где вторая часть служит ласкательным или усилительным компонентом.

Суффикс -ов превращает имя в фамилию по общерусской патронимической схеме, то есть «сын Рахимжона». В самой Средней Азии, откуда фамилия происходит, она чаще встречается в исконной форме Рахимжонов, а не Рахимжанов, хотя оба варианта возможны. Второй вариант (через «а») — результат адаптации к более привычному для русского уха звучанию или упрощения произношения в документах.

Географически фамилия Рахимжонов прочно привязана к Узбекистану, Таджикистану и отчасти к югу Казахстана. В России и других постсоветских странах она встречается почти исключительно у выходцев из этих регионов. Интересно, что в отличие от фамилий на -ов, образованных от славянских имён (Иванов, Петров), здесь суффикс не указывает на сословие или этническую принадлежность носителя — это чисто бюрократическая русификация, которая в XX веке стала стандартом для всех народов Средней Азии.

Сравнение с однокоренными фамилиями (Рахимов, Рахмонов, Рахимжанов) показывает, что Рахимжонов — более редкая и конкретная форма. Если Рахимов означает «потомок Рахима», то Рахимжонов уточняет, что предка звали именно полным двусоставным именем. В ономастике это называют «различительной функцией суффикса»: он не меняет корневого смысла, но сужает круг возможных родоначальников.

Никаких сведений о дворянском происхождении или принадлежности к конкретным историческим родам у фамилии нет — это массовая фамилия крестьянского и городского населения советского периода.